Mis vahe on valgu motiivil ja domeenil?


Vastus 1:

Täname A2A eest

kuid ma arvan, et Ameya Dravid vastas teie küsimusele õigesti.

Niisiis, põhimõtteliselt on valgu motiiviks supersekundaarne struktuur, mis koosneb alfa-heeliksist ja / või beeta-lehest ja juhuslikust mähist. Sellel ei pruugi olla bioloogilisi funktsioone.

Kuid valgu domeenid on 3-mõõtmelise struktuuriga valgu peal / sees, mis võib suhelda teiste valkude / makromolekulide / molekulidega ja millel on mõned bioloogilised funktsioonid. Näiteks on transkriptsioonifaktorid (TF) valkude rühm, millel on 'DNA-d siduvad domeenid'. TF-d istuvad DNA promootori või võimendaja segmendil, kasutades nende 'DNA-d siduvat domeeni) enne DNA-st RNA sünteesi / ajal. Mõnel TF-l on domeen, mida nad seovad DNA peamise soonega, mõned seonduvad väiksema soonega.

1. redigeerimine:

Motiivid ei ole iseseisvalt stabiilsed (valgu suhtes stabiilsed). Motiivid võivad olla domeenide osad.

Domeenid on sõltumatult stabiilsed.

2. redigeerimine:

Kui motiivil võib olla bioloogiline funktsioon, võib seda nimetada domeeniks. Nt: tsingi-sõrme motiivid on seotud DNA sidumisega, mistõttu neid nimetatakse ka tsingi-sõrme domäänideks.

Niisiis, kõik need vahendid tähendavad, et motiivid on struktuuriomadused ja domeenid on valgu funktsionaalsed piirkonnad.


Vastus 2:

Motiivi määratletakse kui valgu super sekundaarset struktuuri. Need võivad olla nii väikesed kui tripeptiid, lihtne aminjärjestus, mis on peamiselt seotud valgu funktsionaalse rolliga. Näited hõlmavad kreeka võtmemotiivi, tsingi sõrme motiivi, Omega silmust jne. Motiivid on enamasti osa domeenist, kuid vastupidi pole see võimalik.

Domeenid on struktuurilt suured üksused ja hõlmavad valgu kvaternaarset struktuuri. Need on sõltumatult volditud valguosad, mida saab diferentseerida nii struktuurselt kui ka funktsionaalselt. Üldiselt peetakse neid suurte valkude korduvateks ühikuteks. Näited hõlmavad beeta-barrelit, PDZ-domeeni, globiini korda, mida leidub enamasti immunoglobuliinides, kadheriini kordusi, mida leidub kaltsiumist sõltuvates adhesioonivalkudes.


Vastus 3:

Valgumotiiv on supersekundaarne struktuur, mis sisaldab mitut sekundaarset struktuuri stabiilses paigutuses ja mida tavaliselt leidub teistes valkudes, millel ei ole tingimata funktsiooni sarnasust.

näiteks: Omega silmus on valgu motiiv, millel on mis tahes aminohapete järjestus, ainsa tingimusega, et see peaks suutma moodustada kreeka tähega omega sarnast stabiilset struktuuri. See muudab motiivi äärmiselt levinud, kuid selle kohta ei saa midagi öelda selle tähtsus valgu funktsioonis.

Vastupidiselt sellele on valgu domeen stabiilne struktuur, millel on valgus spetsiifiline ja kindel funktsioon ning mis võib eksisteerida valgust sõltumatult, st suudab säilitada oma struktuuri ka siis, kui see on valgust eraldatud.

Näiteks: SH2 (src homoloogia 2) domeene leitakse JAK-STAT raja signaalimisradadel, mis vastutavad teatud geenide transkriptsiooni kontrolli eest. Selle domeeni ülesandeks on seda domeeni sisaldava valgu sidumine membraanivalgu spetsiifiliste saitidega.